Badania fizykochemiczne i mikrobiologiczne próbek żywności wykonuje się w próbkach pobranych przez pracowników Państwowej Inspekcji Sanitarnej jak i dostarczonych do laboratorium przez klienta.

Podstawę do oceny jakości zdrowotnej partii środka spożywczego mogą stanowić wyłącznie wyniki badań próbki/próbek pobranych przez pracownika Państwowej Inspekcji Sanitarnej w sposób określony w Rozporządzeniach Ministra Zdrowia i Polskich Normach. Tylko badanie tak pobranej próbki lub próbek umożliwia ocenę rzeczywistych właściwości badanej partii środka spożywczego.

W przypadku dostarczenia próbki przez klienta uzyskane wyniki badań i ich ocena są odnoszone wyłącznie do dostarczonej i zbadanej próbki. W tym wypadku wyniki badań nie mogą być wykorzystane do oceny jakości zdrowotnej całej partii środka spożywczego, z której pobrano i dostarczono do badań jednostkową próbkę. Laboratorium nie ponosi wówczas odpowiedzialności za pobór i transport otrzymanej do zbadania próbki. Jednocześnie należy pamiętać, że próbki środków spożywczych do badań w kierunku zanieczyszczeń mikrobiologicznych winny być pobierane w sposób jałowy, do jałowych opakowań* i dostarczone do laboratorium w ciągu 4 godzin od czasu pobrania, przy zachowaniu odpowiedniej temperatury podczas transportu (zastosowanie termotorb, termosów).
Żywność genetycznie modyfikowana - dostarczona do badań próbka żywności genetycznie modyfikowanej powinna składać się z całego (nienaruszonego) opakowania jednostkowego produktu, a w przypadku produktów rozprowadzanych luzem powinna być umieszczona w odpowiednim sterylnym pojemniku. Pojemnik ten należy całkowicie zapełnić, a jego zamknięcie powinno zabezpieczać przed ewentualnym wyciekiem. Próbkę należy dodatkowo umieścić w zewnętrznym opakowaniu ochronnym i transportować do laboratorium najlepiej w temperarurze poniżej 15^oC. W przypadku produktów mrożonych należy je dostarczyć do laboratorium w stanie zamrożenia.